Los modelos moleculares proceden de la base de datos Protein Data Bank, donde se centralizan internacionalmente las estructuras de proteínas y ácidos nucleicos, determinadas por estudios de RMN o de cristalografía de rayos X. También hay estructuras en la Nucleic Acid Database. Estos archivos PDB, disponibles por internet, son leídos por el programa Rasmol (disponible de forma gratuita en internet), que los transforma en modelos tridimensionales que se pueden girar, cambiar de tipo de representación, colores, etc. Los archivos scripts generados desde Rasmol pueden ser leídos por Chime (también gratuito), que los presenta dentro de una página web.

Direcciones web: 

Rasmol:

Página principal en Univ. Massachusetts (programa, información y aplicaciones):

  http://www.umass.edu/microbio/rasmol/index.html

Descarga directa del programa:

Desde las páginas de la Univ. de Massachussetts (arriba)
o desde la Univ. de Edimburgo (más rápido), en:
  http://www.dcs.ed.ac.uk/home/rasmol/
( leer INSTALL y luego descargar raswin.exe o raswin32.exe, y además rasmol.hlp y raswin.hlp )

Chime:

Página principal en Univ. Massachusetts (información y aplicaciones):

http://www.umass.edu/microbio/chime/index.html

Página principal en MDL (casa comercial propietaria del programa):

http://www.mdlchime.com/chime/

  Si necesitas la versión para Windows 3.1, escríbeme.

Protein Data Bank (antes Brookhaven, ahora RCSB) :

Página principal en EE.UU.:   http://www.rcsb.org/pdb

Duplicados en Europa (recomendable, mucho más rápidos):

  1. en el Reino Unido (Cambridge):  http://pdb.ccdc.cam.ac.uk/pdb/

Buscadores en PDB:

Búsqueda simple, sólo por código PDB: "PDBsum": http://www.biochem.ucl.ac.uk/bsm/pdbsum

Búsqueda simple: "PDB Lite":    página principal de información:    http://www.pdblite.org/
                                                    páginas de búsqueda:
                                                         en Boston Univ. (USA):    http://www.pdb.bu.edu/oca-bin/pdblite
                                                         en Cambridge (UK):  http://pdb.ccdc.cam.ac.uk/oca-bin/pdblite
                                                      o en EBI (UK):   http://oca.ebi.ac.uk/oca-bin/pdblite
                              "PDB SearchLite" en RCSB (USA):   http://www.rcsb.org/pdb/searchlite.html

Búsqueda avanzada: "OCA Browser":
                                                        en EBI (UK):  http://oca.ebi.ac.uk/oca-bin/ocamain
                                                        en Cambridge (UK):  http://pdb.ccdc.cam.ac.uk/oca/

Nucleic Acid Database:

en USA (Rutgers Univ., New Jersey):  http://ndbserver.rutgers.edu/NDB/
en el Reino Unido (Inst. Cancer Research):  http://www.ndb.icr.ac.uk/

Páginas de la Universidad de Massachusetts en las que se basan estas páginas de modelos moleculares de Biomodel:

http://www.umass.edu/microbio/chime/prsswc/template.htm


Enlaces verificados el 8 de mayo de 2002.