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Modelo de bicapa lipídica y canal de gramicidina
Incluido en el "Índice Mundial de Recursos de Visualización Molecular" ( World Index of Molecular Visualization Resources ).
Lipid Bilayers and the Gramicidin Channel -- in English.

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¿Puedes ver moléculas rotando en las esquinas superiores de esta página? Si ves  en su lugar, es que no tienes instalado Chime. No podrás ver la bicapa lipídica a no ser que tengas instalado el conector o plug-in Chime. Descarga el instalador de Chime. Si tienes problemas, consulta aquí (en inglés).

   A diferencia de otras páginas de presentación de modelos moleculares, ésta no debe recorrerse en cualquier orden; sólo funciona correctamente si se pulsan los botones  en el orden en el que aparecen. Por otra parte, aunque el usuario puede mover las moléculas o cambiar su forma de representación usando el ratón y el menú emergente de Chime, esto alterará el resto de la presentación.
Se han señalado así los botones que se pueden utilizar como 
puntos de inicio para restaurar la secuencia correcta de presentación.

   En consecuencia, se recomienda que la primera visita se limite a ir pulsando todos los botones, de uno en uno y por orden, observando el modelo, y sólo después se empiece a experimentar con el movimiento manual del modelo o la utilización de los botones en otro orden.
   También se puede usar el programa Protein Explorer para rotar, ampliar, reducir, cambiar los colores y la forma de representación de estas moléculas (enlaces a Protein Explorer más abajo).

Para ir a cada una de las siguientes secciones, pulsa el botón "Comenzar la Presentación" y luego el enlace "Página Siguiente" hasta que llegues a la sección deseada.
Secciones:
  • Colesterol
  • Fosfolípido
  • Bicapa lipídica
  • Canal de gramicidina
Esta presentación puede descargarse para su uso sin conexión a internet.

Para explorar las moléculas de esta presentación en Protein Explorer (en inglés): 
Colesterol
Fosfatidilcolina (PC)
20 PC's en modelo cristalino de monocapa
40 PC's en modelo cristalino de bicapa, hidratada		 bicapa de PC hidratada: 
modelo cristalino
modelo en gel
modelo fluido		 Canal de gramicidina en bicapa de PE, hidratada

   Este formato en página web usando Chime es © 2001 de  (Depto. Bioquímica y Biología Molecular, Universidad de Alcalá, 28871 Alcalá de Henares, España).
   Desarrollado y traducido a partir de un script para Rasmol, © 1997  (Dept. Microbiology, University of Massachusetts, Amherst, MA 01003-5720, U.S.A.).
   Se permiten el uso y la copia con fines educativos no comerciales. El uso comercial exige un acuerdo previo con los autores.

   Incluye una simulación mediante dinámica molecular de la bicapa de fosfatidilcolina en agua, realizada por H. Heller, M. Schaefer y K. Schulten en el Theoretical Biophysics Group, Beckmann Institute, University of Illinois, Urbana-Champaign, U.S.A. ("Molecular dynamics simulation of a bilayer of 200 lipids in the gel and in the liquid-crystal phases", J. Phys. Chem. 97:8343-60, 1993).
   Incluye también una simulación por dinámica molecular de la gramicidina en una bicapa, realizada por  , T.B. Woolf y  en CENG, Centre d'Etudes Atomiques, Grenoble, Francia, y Chemistry Dept., Université de Montreal, Montreal H3C 3J7 Canadá. ("A molecular dynamics  study of gating in dioxolane-linked gramicidin A channels", Biophys. J. 67:1370-86, 1994).

   Más modelos moleculares que usan Chime, en español, en Biomodel: http://www2.uah.es/biomodel

   Hay otros recursos con Chime en español en el "Índice Mundial de Recursos de Visualización Molecular" ( World Index of Molecular Visualization Resources ). 


Versión Biomodel-2v0 - abril 2001 ;  Biomodel-2v0a - mayo 2004