Visión 3D obtenida por Protein Explorer al realizar un alineamiento múltiple de secuencias (MSA3D): Enolasa

Se preparó en primer lugar un alineamiento múltiple de secuencias para la enzima enolasa. La herramienta MSA3D de Protein Explorer a continuación asignó colores que representaban identidad, semejanza o diferencia a los aminoácidos alineados, mostrados en la lista de alineamiento de Protein Explorer. El alineamiento incluye eubacterias, arqueobacterias, y eucariotas (Drosophila, levadura, y humanos). A pesar del enorme intervalo de tiempo evolutivo, todos los residuos del centro activo son idénticos. (El centro activo se identifica por la posición del sulfato rojo, unido al centro activo en esta estructura, 4enl.)

Si Ud tiene Chime instalado, puede ver cómo la molécula rota en la pantalla de forma interactiva. Si no lo tiene instalado, descargar Chime e instalarlo requiere apenas unos minutos.

Los enlaces y los botones de la imagen no funcionan puesto que se trata de una imagen estática.
Agradecemos a Paul Stothard por su contribución en la generación del código de MSA3D , y a Garry Duncan por suministrar este alineamiento.

¿Cómo se encuentra MSA3D una vez iniciado Protein Explorer? Si inicia Protein Explorer a partir del enlace especial que encontrará más abajo, accederá a un enlace con MSA3D directamente. La mayoría de los otros enlaces a Protein Explorer le llevarán primero a la pantalla de Vista Preliminar. Desde Vista Preliminar, haga click en "Explorar Más", y entonces encontrará un enlace a "Explorer Avanzado", desde donde accederá al menú MSA3D. La demostración sobre la enolasa está basada en la herramienta MSA3D.

Este enlace especial Enolasa-MSA3D inicia Protein Explorer, carga la enolasa, y cambia automáticamente desde Vista Preliminar a Explorer Avanzado, en donde el enlace a MSA3D será evidente.

Se proporciona un tutorial detallado para entender cómo se construye un alineamiento y cómo se utilizan los colores para colorear la molécula de interés con MSA3D.