Comandos de Chime

Los comandos enviados a Chime controlan la imagen de la molécula. Para mandar un comando a Chime, tecléelo en la ventana de comandos (la que contenía inicialmente la frase "#Entre los comandos aquí") y apriete Intro. En el tutorial se explican muchos ejemplos de comandos (entre en Explorer Avanzado, y haga click sobre el interrogante verde cerca del extremo superior de su ventana).

Los comandos previamente ejecutados pueden recordarse con el botón  Recordar ^ . Si recupera demasiados, retroceda hacia abajo con el botón  v . Una vez recuperado un comando, Ud. puede editarlo (si lo desea), y a continuación apriete Intro para ejecutarlo. La acción de recordar comandos también puede hacerse con los atajos de los  comandos PE.

Se definen Abreviaturas que escritas responden como  algunos comandos . Por ejemplo, s es un sustituto de select, de forma que el comando "s thr" será mandado a chime como "select thr". Para ver la lista de abreviaturas que funcionan, y las instrucciones sobre como utilizarlas , haga click en Mostrar abreviaturas debajo de la ventana de mensajes.

El lenguaje de comandos de Chime es muy semejante al de  RasMol. La mejor manera de empezar es comenzando con los ejemplos contenidos en el  Tutorial de Protein Explorer . Para verlo, haga click sobre cualquier interrogación verde fuera de esta ventana de ayuda. Una introducción útil a los comandos de selección de grupos de átomos o de porciones de la molécula puede encontrarse en el documento  Comandos de selección en  Chime y RasMol. Todos los comandos  RasMol se encuentran perfectamente documentados en el Manual de referencia Rasmol. Los comandos adicionales de chime están documentados en la fuente originaria de  Chime, MDL Information Systems. Desde mayo de  1998, la documentación en MDL incompleta. Algunas informaciones adicionales pueden encontrarse en el  Sitio Chime de UMass

Comandos para  Protein Explorer (PE)

Los Comandos a  PE en sí mismo ("Comandos PE ") se introducen en la misma ventana que los comandos a chime, pero no se envían a chime y no afectan a la imagen de la molécula. Sin embargo, afectan al estado de  PE, o a lo que hace  PE. Los comandos PE  son breves  (un o dos caracteres) y se utilizan caracteres fáciles de teclear (sin mayúsculas, por ejemplo).

Comandos PE:

,     Recordar comando anterior (lo mismo que el botón [Recordar ^]).
.     Recordar más comandos recientes (como el botón  [v]).
.c     Ir al panel de control de esquemas de colores.
.f     reiniciar chime.
.l     Ir al panel de Cargar moléculas.
.q     Salir.
.s     Ir al panel de control de Superficies.
.w     Limpiar la ventana de mensajes.
.x     Ir al panel de Exploración.

Solo Comparator
.o     Cambiar el control a la Otra molécula (superior o inferior).
tb     "Superior e inferior". Los comandos prefijados con  tb se envían a ambas ventanas de chime, superior e inferior. Por ejemplo, tb ssb muestra los puentes disulfuro en el modo esqueleto en la molécula superior y en la inferior.  El prefijo tb evita teclear el mismo comando dos veces y cambiar la ventana activa de la molécula . Vea también la abreviatura alias sy  que sincroniza en ambas direcciones.