Presentación de estos "Complementos Visuales"		Volver a la página principal
Información sobre los programas utilizados	¿Cómo puedo configurar mi ordenador para visualizar estas páginas?	Enlaces a otras páginas web con material relacionado

Presentación:

      El objeto de estos "complementos" (Biomodel-1, -2 y -3) es facilitar la comprensión de la estructura tridimensional de las biomoléculas. Creemos que ésta es difícil para la mayoría de personas si se aborda según el método clásico, a base de esquemas, dibujos o modelos moleculares en la representación bidimensional, impuesta por el medio impreso. Es nuestro convencimiento que la visualización de la molécula en movimiento permite apreciar su aspecto tridimensional y así con mayor rapidez y mucho menor esfuerzo de imaginación asimilar las características espaciales, de las que dependen tantos aspectos de la función de estas biomoléculas.

• Biomodel-1

      Como experiencia piloto incluimos un primer módulo, dedicado a la estructura del DNA. Se estudian en primer lugar de forma breve los pares de nucleótidos (pares de bases o bases apareadas), como ladrillos fundamentales en la construcción de la molécula de DNA. Se pasa rápidamente a analizar los aspectos que nos han parecido más reseñables en cuanto a la estructura tridimensional del DNA, sólo a nivel de estructura secundaria, estudiando primero la forma B o de Watson y Crick y luego las variantes, formas A y Z. Por último, se aborda la interacción del DNA con proteínas tales como factores de transcripción, a través de los motivos estructurales proteicos especializados en esa interacción, con estructuras características como son los dedos de zinc, cremalleras de leucina, homeodominios, etc. Se ha incluido este apartado por su íntima relación con la estructura secundaria del DNA, recién estudiada.
      Este material inicial dio pie a la elaboración de un segundo módulo que recoge la estructura de las proteínas, desde sus aminoácidos constituyentes pasando por los modelos de estructura secundaria, para llegar a ilustrar las estructuras terciaria y cuaternaria con dos ejemplos clásicos, la hemoglobina y las inmunoglobulinas G.
      Tras añadir material adicional sobre la estructura del RNA y su interacción con proteínas, actualmente todo está integrado bajo un índice común, que lo organiza en 5 apartados: proteínas, DNA, interacción DNA-proteínas, RNA, e interacción RNA-proteínas.

• Biomodel-2

      Esta sección incluye un modelo de bicapa lipídica, ejemplo de la organización molecular de las membranas biológicas y del papel de los lípidos en ellas.

• Biomodel-3

      En este caso se trata de un módulo de contenido simplificado, enfocado hacia los estudiantes de enseñanza secuundaria que se enfrentan por primera vez a la estructura tridimensional de las biomoléculas.

      Esperamos que este material sea útil, facilitando la comprensión de las moléculas que son base de las asignaturas de Bioquímica y Biología Molecular. Se ha elegido el formato de página web por dos razones: en primer lugar, permite ofrecer un soporte unificado e integrado, combinando las imágenes en movimiento con texto aclaratorio o que dirija la atención a determinados aspectos. Por otro lado, la instalación en el servidor web permite la corrección y actualización constante de los contenidos, evitando la necesidad de reinstalar el software en cada ordenador.

      La forma de presentar el material ha sido posible gracias a la disponibilidad, de forma gratuita, del programa Chime (Chemscape Chime plug-in for Netscape), motor de la presentación y animación de los modelos moleculares, y en concreto de una plantilla de página web que lo utiliza, ofrecida por

a quien estamos profundamente agradecidos, pues ha facilitado tremendamente la elaboración de estas páginas.

      Todo el material (contenidos, programa visualizador de las moléculas y explorador o navegador de internet) está, pues, disponible bajo la forma de software de dominio público, gratuito, de forma que se posibilita su uso para docencia y autoaprendizaje sin ninguna limitación económica o de licencias.

Información sobre los programas utilizados

¿Cómo puedo configurar mi ordenador para visualizar estas páginas?

Empezar a ver Biomodel-1,  Biomodel-2  o  Biomodel-3 [o el nuevo Biomodel-3 en Java]

Enlaces a otras páginas web con material relacionado

Material desarrollado por

Biomodel-1 se mantiene en paralelo en dos servidores web:

Servidor en Alcalá www2.uah.es/biomodel

Servidor en Valladolid analisis.med.uva.es

      Este material puede ser usado libremente con fines docentes o de auto-aprendizaje. En caso de su utilización de modo estable, se ruega una comunicación a los autores, con fines puramente informativos. Asimismo, se agradecerá cualquier comentario, sugerencia o informe de problemas o errores.